服部平次和柯南脱离大部队，撒开脚丫子开始在满船的犄角旮旯到处乱窜搜查线索，最后在船尾汇合。
柯南在下面机房的地板上找到了血迹和手枪的空弹壳，还有一封信，信是用打印机打出来的，信上写着「在机房等你，古川大」。
服部平次则在餐厅旁的男洗手间里找到一张被揉皱了的纸条，纸条上同样是打印机的字体，上面写着「在船尾等你，古川大。」。
柯南和服部平次相视一笑，心照不宣，各自心里都有了答案。
柯南和服部平次的推理很简单，他们没有在火灾现场找到固定引火装置，凶手只有可能是趁大家被枪声吸引到在甲板上时，躲开他们跑去在船尾放火烧掉箱子。
在枪响时和他们一起行动的鲛崎警视和鲸井先生，以及在放火前赶到甲板上和他们汇合的矶贝小姐，他们三人都有充分的不在场证明。
这样一来，在现在无法确定尸体是谁的情况下，没有不在场证明的只有龟田和蟹江，以及一直不见踪影自称是叶才三的神秘老人。
但这么简单的障眼法可骗不过身经百战的柯南和服部平次都，那个谁都没见过真容的神秘老人很明显是凶手的圈套，那就是个根本不存在的人。
现在真相已经浮出水面了，要么是蟹江杀了龟田，要么是龟田杀了蟹江，而且凶手还表演了一出分身术，假扮成那个神秘老人脱罪，甚至那个人可能就是传说中的叶才三本人。
推理结束，服部平次和柯南一起说出最后的答案。
服部平次先开口说：“现在凶手很明显就是那个人。”
柯南也说出自己的答案：“没错，就是那个伪装成死者，让大家以为他已经死了，其实他躲在在某个地方的……”
“你在说什么啊？”服部平次诧异地打断柯南的话，一把摘掉尸体上的手表说，“死者就是蟹江啊！你看这只表，这不就是证据嘛！所以龟田就是叶才三，他用这么残忍的手段杀死蟹江就是为了复仇，而且我想他下一个目标就是鲸井。”
柯南激动地反驳道：“你才是在说什么呢！你难道看不出来这是蟹江设计的圈套吗？蟹江故意给龟田的尸体戴上容易识别的手表，他就是要让我们以为他已经死了，并且把罪名嫁祸给那个失踪的叶才三，而他则暗中躲在某处。”
柯南和服部平次互相看着彼此，柯南坚持选a，服部平次坚决选b，各自坚持着自己的推理，寸步不让！
服部平次站起来，俯视着柯南，笑道：“真有趣啊，我们好久没有意见相反了。”
柯南双手插兜，眼神认真起来，回道：“是啊，那还是我们第一次碰面的时候。”
服部平次回击道：“我们再来比比看吧，看看这次谁能破案？”
柯南和服部平次的眼中充满斗志。
但是，这两人似乎忘了上次破案的是……是兔川呐！
兔川这边和中原中也聊得正起劲呢，中原中也说已经派人去接他们了，兔川想起港黑那一水儿的传统黑色西装，也不知道该说什么是好。
不过，兔川也想看看柯南对上异能力会产生什么特别的化学反应？
中原中也在电话里和兔川说：“也不知道是什么原因，最近地中海的西西里岛那边向我抛出了橄榄枝，以前那边可看不上我们这种远东乡下的小组织，我们就顺便做了点海产生意，哈哈哈，我下次见到那个青花鱼，一定好好要和他炫耀一下！”
兔川当然知道是什么原因，只能说：“呵呵，你加油吧！”
兔川也没有想到他去文野世界溜达一圈，并盛町就在他们东京圈子里安了家，而且还紧挨着横滨，和横滨脚前脚后落地，兔川都没注意到。